Karen Joy Fowler 1950 Şubatında, babasının psikoloji profesörü olduğu Bloomington, Indiana'da doğdu. 11 yaşına gediğinde ailesiyle birlikte Kaliforniya Palo Alto'ya taşındı. Kaliforniya Üniversitesinde politik bilim okudu ve Davis Üniversitesindeki mastırının son yılında bir bebeği oldu. Daha sonra yazmaya başladığı bilim kurgu hikâyeleri sayesinde adını duyurdu. Fowler, iki yetişkin çocuğu ve eşiyle birlikte Davis ve Santa Cruz'da yaşıyor.